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核仁的化学组成是不恒定的，是依细胞的类型和生理状态而异，但一般来讲，核仁都含有三种主要成分：DNA、RNA和蛋白质。核仁的主要功能是进行核糖体 RNA(rRNA)的合成。细胞内RNA有信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)三种，它们主要存在于细胞质中。细胞核内含有少量的RNA，但核内RNA同样也有这三类且核内RNA大部分存在于核仁中。不论是细胞质基质中的RNA，还是细胞核中的RNA，都是在细胞核内以DNA的一条链为模板转录而成的。现在已经知道核糖体RNA的基因位于核仁组成中心的副缢痕上，而该部位则是形成核仁的地方，它转录形成核糖体RNA的部位就是核仁区。核糖体RNA合成后，通过核孔进入细胞质中，然后与在细胞质中合成的核糖体蛋白质联结形成核糖体。

线粒体的外膜比内膜的磷脂含量要高２－３倍：因其内膜上含有大量与有氧呼吸有关的酶(属于蛋白质)，而其外膜上所含蛋白质要少得多。

线粒体和叶绿体都含有少量的DNA和RNA，它们具有半自主性(能合成一部分蛋白质和酶)，因此线粒体和叶绿体中的少量的RNA和DNA能直接或根本上控制一部分性状。