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　　指DNA上形成的损伤（非正常结构）。在DNA复制后，由于细胞内存在的酶的作用有时会引起碱基修饰（如甲基化）等变化，可看作是正常的状态，不归入损伤之列。DNA损伤可大致分为碱基损伤和D-NA链损伤二类。（1）DNA碱基损伤（base dam-age），可进一步分为（i）配对性损伤（pairable da-mage）为碱基的微小的变化。它虽可保持复制时作为模板的能力，但它所产生的配对错误比正常碱基的比率要高，但也有错误配对比率与正常碱基完全相同的情况。（ii）非配对性损伤（non-pairable dam-age），DNA复制时发生较大的碱基变化以至不能作为模板。非配对性损伤还可进一步分为；（a）包括碱基脱落的破坏性化学变化。（b）其他的化合物和碱基结合而成为附加体（adduct）。（c）因相邻的碱基相结合产生二聚体（dimer），（d）两条链上原先不该配对的碱基直接地或者以其他化合物作为媒介由共价键产生桥等等。例如，在自然状态下长时间放置的DNA或用烷化剂处理后的DNA可产生脱嘌呤（特别是尿嘌呤）。用4NQO（氧化型4-硝基喹啉）在体内作用，就会产生嘌呤-4NQO附加体。用紫外线照射则会产生嘧啶二聚体，丝裂霉素C在状内作用，由于它的媒介，在二条链的鸟嘌呤和鸟嘌呤间形成桥。（2）DNA链损伤（strand damage）：主要为一条链断裂和二条链断裂。如糖的变化，小的损伤对DNA的复制可完全没有影响，但稍为大一点的变化连连发生，则容易引起变化往往最终导致一条链断裂（例如用X线照射使水分解产生OH游离基，OH游离基作用糖，很快就导致一条链断裂）。上述的脱嘌呤也常常导致一条链断裂。当然，磷酸酯键的化学变化也时常导致一条链断裂（例如X线照射，引入³²P的蜕变而产生的³²S的原子核变换）。一条链断裂必然以一定的比率导致二条链断裂。后者往往是致死的主要原因。