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初生代谢产物是植物生长和发育必需的,也是合成次生代谢产物的重要原料。糖类、脂肪、核酸和蛋白质等是初生代谢的初生代谢产物。
次生代谢产物是指植物中一大类并非植物生长发育所必需的小分子有机化合物,其产生和分布通常有种属、器官组织和生长发育期的特异性，包括紫草素、紫杉醇、酚类（绿茶中的茶多酚）、白桦树中的木糖醇、黄酮类、香豆素、木脂素、生物碱、糖苷、萜类、甾类、皂苷、多炔类、有机酸等。次生产物在植物中的合成与分解过程称为次生代谢。

初级代谢产物是指微生物通过代谢活动所产生的、自身生长和繁殖所必需的物质，如氨基酸、核苷酸、多糖、脂质、维生素等。在不同种类的微生物细胞中，初级代谢产物的种类基本相同，没有特异性。此外，初级代谢产物的合成在不停的进行着，任何一种产物的合成发生障碍都会影响微生物正常的生命活动，甚至导致死亡。
次级代谢产物是指微生物生长到一定阶段才产生的化学结构十分复杂、对该生物无明显生理功能，或并非是微生物生长和繁殖所必需的物质，如抗生素、毒素、激素、色素等。不同种类的微生物所产生的次级代谢产物不相同，具有特异性，它们可能积累在细胞内，也可能排到外环境中。